182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3224 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  100 
 
 		 413 aa  822    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  34.66 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.32 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  35.43 
 
 		 590 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  30 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  27.38 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  31.34 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  31.2 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  27.05 
 
 		 647 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  29.86 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  32.25 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  26.88 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  25.98 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  39.74 
 
 		 617 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  35.44 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  24.4 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.43 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.78 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  36.47 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  36.47 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  34 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  30.19 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  31.65 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  41.33 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  34.88 
 
 		 184 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  38.89 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  38.89 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  21.85 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.29 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  24.17 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  25.5 
 
 		 719 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  30.68 
 
 		 121 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  33.75 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  33.75 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  19.4 
 
 		 632 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  39.24 
 
 		 237 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.87 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  25.61 
 
 		 541 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  28.82 
 
 		 747 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  29.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  30.38 
 
 		 137 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  35.44 
 
 		 275 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.75 
 
 		 112 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  32.5 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  32.5 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  24.75 
 
 		 629 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  35.8 
 
 		 273 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  24.75 
 
 		 629 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  26.82 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.12 
 
 		 202 aa  53.5  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  19.12 
 
 		 585 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  32.5 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  33.33 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  19.12 
 
 		 585 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  19.12 
 
 		 585 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  24.66 
 
 		 640 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  24.39 
 
 		 858 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  34.57 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  32.93 
 
 		 274 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  28.76 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  35.48 
 
 		 206 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.83 
 
 		 589 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  32.93 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  32.93 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  31.76 
 
 		 138 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  35.94 
 
 		 206 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  33.75 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  30.77 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  32.93 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  21.92 
 
 		 671 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  35.06 
 
 		 582 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  32.5 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  34.57 
 
 		 266 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  34.57 
 
 		 266 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.53 
 
 		 244 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  32.5 
 
 		 264 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.53 
 
 		 244 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  32.22 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  28.49 
 
 		 621 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  33.71 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  34.83 
 
 		 319 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  32.05 
 
 		 234 aa  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  20.67 
 
 		 598 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.86 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  20.66 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  34.18 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  27.84 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  25.53 
 
 		 728 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  37.5 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  37.1 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  35.96 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  35.44 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  32.18 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  29.03 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  23.13 
 
 		 631 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  35.06 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  25.32 
 
 		 138 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  22.22 
 
 		 750 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>