More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3215 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  57.42 
 
 
214 aa  228  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  39.05 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.58 
 
 
222 aa  158  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.19 
 
 
217 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  39.05 
 
 
219 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  38.35 
 
 
225 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  40.72 
 
 
217 aa  147  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  40.72 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.59 
 
 
221 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  41.06 
 
 
237 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.59 
 
 
221 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.25 
 
 
221 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  37.2 
 
 
221 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  37.25 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  37.25 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  37.25 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  38.16 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.25 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  41.75 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  41.06 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  41.78 
 
 
219 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  36.76 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.75 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  40.58 
 
 
216 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  42.33 
 
 
221 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  40.31 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  40.22 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  40.22 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  40.22 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  41.8 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.23 
 
 
235 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  35.35 
 
 
220 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  40 
 
 
228 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.28 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.97 
 
 
220 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  39.15 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.39 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  38.04 
 
 
291 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.5 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  36.41 
 
 
220 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  38.19 
 
 
228 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.36 
 
 
231 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.24 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.38 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.54 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.16 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.08 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.15 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  29.81 
 
 
211 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  32.71 
 
 
232 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.29 
 
 
228 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  33.02 
 
 
247 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.58 
 
 
220 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  36 
 
 
231 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  33.33 
 
 
221 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  28.95 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.26 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.72 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  34.26 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.95 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  26.96 
 
 
225 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.53 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.91 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  32.57 
 
 
263 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  31.37 
 
 
252 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.14 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  25.98 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.73 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  34.26 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
252 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
252 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
218 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
252 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  32.64 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  27.51 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  27.51 
 
 
238 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  27.39 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  33.69 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 
252 aa  84.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.61 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>