93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3185 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  40.16 
 
 
129 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
134 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  40.16 
 
 
139 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 
136 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  43.86 
 
 
133 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
135 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  37.6 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  39.34 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  39.84 
 
 
147 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35 
 
 
138 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  36.72 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  36.72 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  36.72 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  24.79 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
156 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
148 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.88 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  27.88 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 
157 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 
148 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  26.45 
 
 
148 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 
148 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 
148 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 
148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 
148 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1329  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  27.84 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.97 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  26.26 
 
 
154 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  26.26 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
283 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  30.77 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 
134 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
155 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.41 
 
 
150 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>