77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3161 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  790    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  40.97 
 
 
379 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  39.2 
 
 
397 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  40.4 
 
 
366 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  40.31 
 
 
395 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  40 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  38.98 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  38.98 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  37.22 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  40.36 
 
 
397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  36.75 
 
 
376 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  35.65 
 
 
427 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  34.77 
 
 
346 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  35.56 
 
 
427 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  31.18 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  34.82 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  29.09 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  33.15 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  33.24 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  32.28 
 
 
410 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  32.28 
 
 
410 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  32.04 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  34.86 
 
 
375 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  30.4 
 
 
417 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  31.02 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  32.68 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  32.07 
 
 
377 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  32.07 
 
 
377 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  32.07 
 
 
426 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  30.81 
 
 
420 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  32.59 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  26.3 
 
 
444 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  32.6 
 
 
451 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  29.84 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  28.03 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  35.48 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  38.28 
 
 
434 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  34.73 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  34.69 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  29.03 
 
 
422 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  30.86 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  30.14 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  34.18 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  34.18 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  34.18 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  29.31 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  31.27 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  31.58 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  30.41 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  29.61 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  30.72 
 
 
424 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  29.61 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  30.72 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  31.43 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  29.03 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  30.07 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  25.93 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  29.09 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  24.85 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  24.85 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  24.85 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06773  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 
448 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355363  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  29.25 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  24.74 
 
 
481 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  24.06 
 
 
450 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  24.85 
 
 
464 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  23.88 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  23.88 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  23.88 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  29.76 
 
 
527 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  30.25 
 
 
527 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  22.81 
 
 
470 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  29.01 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  28.95 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  33.74 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  23.84 
 
 
446 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  25.77 
 
 
528 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>