220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3154 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  53.98 
 
 
598 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  78.58 
 
 
592 aa  967    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  54.93 
 
 
624 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  54.62 
 
 
598 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  56.57 
 
 
599 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  55.1 
 
 
620 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  56.06 
 
 
596 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  55.44 
 
 
593 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  55.41 
 
 
595 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  54.31 
 
 
640 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  55.35 
 
 
657 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  55.46 
 
 
606 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  53.98 
 
 
606 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  55.59 
 
 
595 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  56.29 
 
 
598 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
593 aa  1216    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  54.35 
 
 
603 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  53.81 
 
 
606 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  54.58 
 
 
618 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  49.66 
 
 
589 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  51.53 
 
 
598 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  51.45 
 
 
594 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  50.25 
 
 
597 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  50.25 
 
 
597 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  39.76 
 
 
593 aa  438  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  39.09 
 
 
593 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  38.42 
 
 
594 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  35.17 
 
 
594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  36.82 
 
 
586 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  34.32 
 
 
594 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  34.7 
 
 
627 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  35.23 
 
 
623 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  34.12 
 
 
625 aa  300  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  34.39 
 
 
602 aa  299  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.69 
 
 
613 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  35.15 
 
 
599 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  33.39 
 
 
612 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  34.44 
 
 
601 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  34.51 
 
 
623 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  34.11 
 
 
611 aa  293  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  35.17 
 
 
619 aa  293  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  33.94 
 
 
613 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 
600 aa  290  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  34.11 
 
 
598 aa  289  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.62 
 
 
597 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  34.89 
 
 
598 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  35.45 
 
 
593 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  34.93 
 
 
602 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  34.77 
 
 
602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  32.28 
 
 
617 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  32.55 
 
 
606 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  33.67 
 
 
595 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.44 
 
 
596 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  34.6 
 
 
600 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  34.04 
 
 
610 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  34.32 
 
 
609 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  34.32 
 
 
609 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.44 
 
 
601 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  35.04 
 
 
616 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  34.21 
 
 
609 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  33.88 
 
 
613 aa  279  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  33.28 
 
 
609 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  34.15 
 
 
609 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  34.54 
 
 
611 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  33.95 
 
 
619 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 
605 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  36.09 
 
 
617 aa  276  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  34.11 
 
 
599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  34.38 
 
 
609 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  34.43 
 
 
612 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  34 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  34.53 
 
 
636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 
608 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  33.61 
 
 
605 aa  274  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 
609 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  32.89 
 
 
850 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 
592 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.55 
 
 
602 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  33.55 
 
 
626 aa  270  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  34.32 
 
 
665 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  34.26 
 
 
610 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 
626 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 
610 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  34.26 
 
 
610 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  34.26 
 
 
610 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  34.26 
 
 
610 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  34.26 
 
 
610 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  34.26 
 
 
610 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  32.45 
 
 
602 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 
624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  32.72 
 
 
612 aa  267  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 
617 aa  267  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 
592 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  33 
 
 
605 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  35.39 
 
 
645 aa  266  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  32.91 
 
 
627 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  32.2 
 
 
603 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  31.69 
 
 
627 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  32.07 
 
 
894 aa  264  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  32.58 
 
 
628 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>