More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3126 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
197 aa  393  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  80.2 
 
 
194 aa  315  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  68.37 
 
 
194 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.51 
 
 
194 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.46 
 
 
201 aa  208  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.69 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.2 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.97 
 
 
200 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.55 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  51 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  52 
 
 
204 aa  188  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  46.12 
 
 
206 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  51.23 
 
 
206 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.69 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.57 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.57 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.48 
 
 
200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.69 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.69 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.57 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.12 
 
 
205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 
205 aa  181  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
203 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
208 aa  180  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.26 
 
 
202 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.85 
 
 
205 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
205 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
205 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
205 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
205 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.5 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.02 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.41 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.02 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.41 
 
 
205 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.41 
 
 
205 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.41 
 
 
205 aa  178  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.34 
 
 
205 aa  177  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.47 
 
 
200 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.47 
 
 
200 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
203 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.23 
 
 
202 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.06 
 
 
223 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
203 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
203 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  43.28 
 
 
203 aa  175  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
203 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
203 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
203 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
203 aa  175  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  43.35 
 
 
203 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.07 
 
 
204 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  43.35 
 
 
203 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
205 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.93 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.37 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.46 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2146  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.57 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.48 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.86 
 
 
203 aa  171  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1819  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.15 
 
 
205 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
203 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
203 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
203 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
205 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
203 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.11 
 
 
209 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.26 
 
 
204 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.37 
 
 
203 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2103  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.66 
 
 
205 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.76 
 
 
211 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.14 
 
 
192 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  41 
 
 
196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.19 
 
 
193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.19 
 
 
193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.29 
 
 
197 aa  164  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
209 aa  164  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  46.7 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  44.5 
 
 
207 aa  161  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
194 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.02 
 
 
193 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
193 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.04 
 
 
200 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.2 
 
 
193 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.41 
 
 
193 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
199 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.42 
 
 
193 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
199 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
199 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.78 
 
 
193 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>