85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3106 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  100 
 
 		 341 aa  696    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  51.08 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  49.2 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  49.2 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  49.2 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  48.79 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  48.4 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  52.84 
 
 		 311 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  45.58 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  49.68 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  47.27 
 
 		 351 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  54.41 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  50.68 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  48.14 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  45.03 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  46.74 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  47.35 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  40.57 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  49.38 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  44.9 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  42.35 
 
 		 495 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  46.09 
 
 		 258 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  38.18 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  39.89 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  46.04 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  36.92 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  39.11 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  39.11 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  37.73 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  41.18 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  41.98 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  41.32 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  39.1 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  35.49 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  43.28 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  43.7 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  42.68 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  36.23 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  36.23 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  42.17 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  44.32 
 
 		 237 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  45.41 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  44.32 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  44.32 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  35.82 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  41.28 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  44.44 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  45.27 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  42.38 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  34.38 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  45.95 
 
 		 236 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  40.07 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  41.31 
 
 		 274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  41.15 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  41.15 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  37.79 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  40.08 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  38.5 
 
 		 256 aa  162  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  36 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  43.24 
 
 		 249 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  40 
 
 		 235 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  40 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  39.71 
 
 		 237 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  37.67 
 
 		 262 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  32.95 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  33.54 
 
 		 354 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  38.61 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  31.47 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  40.74 
 
 		 246 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  34.29 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  32.45 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  23.79 
 
 		 803 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2931  hypothetical protein  25.62 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1064 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  61.22 
 
 		 664 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  55.32 
 
 		 188 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  48.84 
 
 		 455 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  40.45 
 
 		 657 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  45.45 
 
 		 629 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  44.26 
 
 		 627 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  52.27 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 740 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  50.88 
 
 		 672 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  40.96 
 
 		 637 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  30.56 
 
 		 551 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>