More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3062 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  86.5 
 
 		 202 aa  330  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.75 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 180 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  32.97 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  32.02 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  34.59 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  30.13 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  30.67 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  32.7 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  32.7 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  32.7 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 332 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.83 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  30.28 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 285 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  25.26 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1038  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0256263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>