More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3061 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  43.35 
 
 		 944 aa  800    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 985 aa  2007    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  52.98 
 
 		 975 aa  995    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  43.87 
 
 		 987 aa  757    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  53.73 
 
 		 974 aa  993    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 981 aa  741    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  44.96 
 
 		 952 aa  819    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 953 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 935 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 930 aa  436  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 930 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 930 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 933 aa  429  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 937 aa  429  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 935 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 935 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 935 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  32.19 
 
 		 936 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1088 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 981 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 965 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 869 aa  351  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 966 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 966 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 897 aa  330  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 873 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 873 aa  326  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 904 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 904 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 907 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 904 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 904 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  28.51 
 
 		 914 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 924 aa  315  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 907 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 901 aa  310  8e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 841 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 838 aa  302  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 912 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 843 aa  300  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 842 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 853 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 853 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 855 aa  295  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 853 aa  295  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 855 aa  290  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 944 aa  287  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.52 
 
 		 853 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.27 
 
 		 839 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 891 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 853 aa  281  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 709 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 836 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 910 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.18 
 
 		 969 aa  269  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 935 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 966 aa  267  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 957 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 969 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 817 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 967 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 938 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  29.35 
 
 		 929 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 855 aa  252  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 927 aa  252  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 944 aa  251  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 847 aa  250  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 852 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 901 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 890 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 861 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.52 
 
 		 880 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 964 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 861 aa  247  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 951 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 857 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 892 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 890 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28 
 
 		 904 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 875 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 861 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 928 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 947 aa  243  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  27.64 
 
 		 877 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 849 aa  241  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 871 aa  240  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 946 aa  240  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 869 aa  237  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1677  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 1041 aa  238  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 884 aa  235  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  25.39 
 
 		 1007 aa  235  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 861 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 1015 aa  234  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 861 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 861 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1752  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 1041 aa  233  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0957088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 1007 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 882 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1007 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2508  TonB-dependent receptor, plug  25.4 
 
 		 1015 aa  231  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.636231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>