More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3044 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  78.38 
 
 		 187 aa  292  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  65.59 
 
 		 188 aa  241  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  64.52 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  41.62 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  41.62 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  42.05 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  41.86 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.2 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  42.86 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  42.61 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  40 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  39.31 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  40.91 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  43.03 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  40.61 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  38.59 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  41.14 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  42.42 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  39.56 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  40.12 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  40 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  40.61 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  36.87 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  37.84 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  38.55 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  41.28 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  34.81 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  39.38 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  39.89 
 
 		 222 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.79 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.11 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.26 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  39.11 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  37.5 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  39.11 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.8 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  36.16 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  38.71 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  35.33 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  38.33 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.81 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  38.42 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.59 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  35.84 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  35.39 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  35.36 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  38.73 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  36.46 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  37.14 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  34.07 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  38.46 
 
 		 177 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  42.01 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  38.46 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  37.7 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  35.36 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  37.64 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  33.15 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.15 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  40.48 
 
 		 172 aa  97.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  34.78 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  36.07 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.81 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  34.78 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  37.02 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  30.64 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  35.36 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  34.78 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  44.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  44.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  44.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  35.14 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  44.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  44.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  37.29 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  34.25 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  44.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  44.64 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  33.7 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.7 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.7 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.7 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.7 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.7 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.7 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  37.7 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  37.7 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.7 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  35.16 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.7 
 
 		 213 aa  95.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  37.36 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  43.45 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.7 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.02 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  37.06 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  33.52 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  39.66 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  38.33 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>