74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3008 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 449 aa  927    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  30.31 
 
 		 653 aa  146  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  34.31 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  34.06 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  30.8 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  28.31 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  32.33 
 
 		 743 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.37 
 
 		 754 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  35.12 
 
 		 698 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.95 
 
 		 743 aa  99  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  30.93 
 
 		 899 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.3 
 
 		 732 aa  93.2  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.36 
 
 		 530 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  31.94 
 
 		 678 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.74 
 
 		 765 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.85 
 
 		 683 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  32.14 
 
 		 810 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  29.68 
 
 		 705 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  33.17 
 
 		 741 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  31.7 
 
 		 587 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.63 
 
 		 729 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  30.39 
 
 		 609 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  30.26 
 
 		 734 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  30.39 
 
 		 609 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  30.1 
 
 		 655 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.11 
 
 		 626 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.91 
 
 		 822 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  29.03 
 
 		 853 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.86 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  26.92 
 
 		 700 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  28.21 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  28.21 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31 
 
 		 568 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.69 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  30.85 
 
 		 781 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  28.72 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.48 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  29.69 
 
 		 851 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.89 
 
 		 685 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.18 
 
 		 805 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  29.9 
 
 		 629 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.86 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  28.88 
 
 		 999 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.28 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.44 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  28.83 
 
 		 685 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  29.45 
 
 		 691 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 845 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  32.2 
 
 		 834 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  23.98 
 
 		 666 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  24.86 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.76 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  24.21 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  30.07 
 
 		 687 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  24.6 
 
 		 638 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  25.5 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  25 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.28 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  31.19 
 
 		 862 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.14 
 
 		 605 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  31.43 
 
 		 517 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.91 
 
 		 795 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  32.5 
 
 		 696 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  33.33 
 
 		 603 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  30.36 
 
 		 598 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.11 
 
 		 662 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  32.41 
 
 		 517 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 603 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.2 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  33.93 
 
 		 900 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.11 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.59 
 
 		 651 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  25.68 
 
 		 597 aa  47  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.09 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>