194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2952 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  100 
 
 
358 aa  689    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  26.87 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  32.45 
 
 
349 aa  93.2  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  28.83 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0032  putative signal transduction protein  31.17 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  27.96 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  26.18 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  26.74 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  27.44 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  27.96 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  27.96 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  29.57 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  27.42 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  27.42 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  29.88 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  29.88 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  29.88 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  23.13 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  22.67 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  28.06 
 
 
730 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.86 
 
 
280 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
397 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  24.81 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
280 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  32.31 
 
 
724 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
285 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  37.04 
 
 
274 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
408 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  22.51 
 
 
282 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
283 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
286 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  30.91 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  30.91 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  30.91 
 
 
274 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  26.67 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  30.04 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1912  hypothetical protein  30.16 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  0.293367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  29.06 
 
 
279 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.23 
 
 
283 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  28.31 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  36.36 
 
 
274 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  27.17 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  22.84 
 
 
283 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
297 aa  56.2  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  32.66 
 
 
358 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  26.4 
 
 
290 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  24.89 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.9 
 
 
718 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.79 
 
 
517 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 
455 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.61 
 
 
274 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  25.89 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  27.01 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.18 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  35.9 
 
 
634 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 
284 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  23.72 
 
 
278 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  33.33 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.04 
 
 
287 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  26.46 
 
 
274 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
427 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1128  putative signal transduction protein  34.67 
 
 
270 aa  52.8  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  24.58 
 
 
280 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  23.26 
 
 
278 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  26.16 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  28.41 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 
293 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.27 
 
 
277 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  26.82 
 
 
299 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.69 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  27.81 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  25.89 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  23.97 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  24.7 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.65 
 
 
305 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  24.88 
 
 
290 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  22.13 
 
 
302 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  29.75 
 
 
586 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.31 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  32.93 
 
 
476 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  26.85 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>