67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2915 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 566 aa  1137    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  29.53 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  29.48 
 
 		 559 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  30.58 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  31.55 
 
 		 558 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  28.75 
 
 		 559 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  29.43 
 
 		 556 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  31.71 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 		 554 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  30.94 
 
 		 591 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  27.5 
 
 		 543 aa  163  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  32.16 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  31.59 
 
 		 453 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  32.92 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  31.92 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  32.92 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  32.67 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  32.41 
 
 		 446 aa  133  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  29.14 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.83 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  29.1 
 
 		 448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  29.1 
 
 		 448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  29.1 
 
 		 448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  29.1 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  29.1 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  29.02 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  29.1 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  29.1 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  30.84 
 
 		 394 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1198 aa  60.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  42.57 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  42.57 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  27.37 
 
 		 335 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  40.91 
 
 		 390 aa  54.3  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 435 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  42.25 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  42.25 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  42.25 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  27.56 
 
 		 333 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  30.57 
 
 		 359 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  36.96 
 
 		 358 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  27.81 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  24.49 
 
 		 290 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  37.08 
 
 		 335 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  32.71 
 
 		 367 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  41.03 
 
 		 388 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  29.41 
 
 		 868 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  28.99 
 
 		 322 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  35.06 
 
 		 377 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  43.1 
 
 		 338 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1272 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  37.63 
 
 		 387 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2717  hypothetical protein  27.78 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.920172  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  31.63 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 338 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  41.79 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  24.16 
 
 		 1237 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1324  hypothetical protein  29.82 
 
 		 231 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.311232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  34.72 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  34.72 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  45.65 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  39.06 
 
 		 366 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 409 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  25.35 
 
 		 333 aa  43.9  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1523  hypothetical protein  27.22 
 
 		 412 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03932e-19 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 394 aa  43.9  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>