95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2876 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1007 aa  2059    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.51 
 
 		 1050 aa  739    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  56.84 
 
 		 1037 aa  1153    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  30.9 
 
 		 972 aa  416  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1007 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  30.16 
 
 		 1007 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 993 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  28.31 
 
 		 1001 aa  348  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1066 aa  333  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  27.96 
 
 		 997 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 991 aa  323  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1066 aa  307  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  27.41 
 
 		 994 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  32.99 
 
 		 485 aa  244  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1126 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1122 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1120 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1054 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 1041 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  23.99 
 
 		 992 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 1188 aa  104  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1109 aa  101  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.01 
 
 		 1056 aa  88.2  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  26.39 
 
 		 1081 aa  83.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 1232 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 1206 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1105 aa  81.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.06 
 
 		 1068 aa  80.9  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1008 aa  80.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 1008 aa  79.7  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1065 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1123 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 1087 aa  74.7  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  26.76 
 
 		 986 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.02 
 
 		 1195 aa  74.3  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1075 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 979 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1125 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1075 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1176 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 1089 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1008 aa  70.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  21.23 
 
 		 1097 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1123 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  23.3 
 
 		 1125 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1173 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 935 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.21 
 
 		 1061 aa  63.9  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  26.05 
 
 		 1010 aa  63.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  24.64 
 
 		 1194 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25.69 
 
 		 1057 aa  63.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1069 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 888 aa  62.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1153 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 952 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.28 
 
 		 1051 aa  61.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1149 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1071 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 1026 aa  60.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  25.07 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1122 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  22.59 
 
 		 1041 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1016 aa  58.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1141 aa  58.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1052 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 1124 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  21.25 
 
 		 1066 aa  56.6  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 966 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 897 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1129 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 1167 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 1114 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 1010 aa  55.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1196 aa  55.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1100 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  25 
 
 		 1067 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  31.18 
 
 		 862 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  24.2 
 
 		 1298 aa  52.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1074 aa  52.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  26.37 
 
 		 511 aa  51.2  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  23.72 
 
 		 1203 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1066 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1053 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.56 
 
 		 1012 aa  49.3  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 871 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 1105 aa  48.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1077 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1068 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  25.99 
 
 		 1116 aa  47  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1257 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.73 
 
 		 1008 aa  45.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  22.31 
 
 		 935 aa  45.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>