More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2817 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  74.43 
 
 
176 aa  270  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  56.77 
 
 
199 aa  227  9e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  55.73 
 
 
215 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  49.06 
 
 
152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  49.06 
 
 
152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  43.4 
 
 
153 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  47.17 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  45.39 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  47.17 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  45.39 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  47.17 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  45.39 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  45.39 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  44.03 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  46.54 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  42.14 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  46.31 
 
 
161 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  43.4 
 
 
151 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  43.4 
 
 
151 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  47.37 
 
 
153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  43.51 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  42.77 
 
 
151 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  42.77 
 
 
151 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  45.28 
 
 
152 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  44.08 
 
 
151 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  40.25 
 
 
152 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  44.74 
 
 
151 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  42.14 
 
 
151 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  44.03 
 
 
173 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  40.88 
 
 
153 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  42.77 
 
 
150 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  42.77 
 
 
150 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  42.77 
 
 
150 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  42.77 
 
 
150 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  42.77 
 
 
150 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  44.67 
 
 
153 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  42.77 
 
 
150 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  42.14 
 
 
150 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  43.42 
 
 
154 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  43.42 
 
 
154 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  44.3 
 
 
140 aa  120  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  42.14 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  46.98 
 
 
145 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  41.51 
 
 
150 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  40.79 
 
 
165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  41.51 
 
 
150 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  42.14 
 
 
158 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  42.14 
 
 
150 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  42.14 
 
 
150 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  42.14 
 
 
150 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  41.51 
 
 
150 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  41.51 
 
 
150 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  41.4 
 
 
153 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  46.21 
 
 
154 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  42.76 
 
 
154 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  42.76 
 
 
154 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  39.62 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  42.95 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  41.51 
 
 
158 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  44.3 
 
 
140 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  39.62 
 
 
151 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  40.25 
 
 
151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  42.11 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  37.82 
 
 
153 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  39.62 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.76 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.82 
 
 
153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  42.28 
 
 
140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  40.94 
 
 
152 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  44 
 
 
151 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  39.6 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  38.36 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  39.62 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  34.97 
 
 
166 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  39.47 
 
 
150 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  37.82 
 
 
151 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  35.03 
 
 
157 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  36.99 
 
 
209 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  33.94 
 
 
166 aa  101  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  40.26 
 
 
144 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  36.77 
 
 
151 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  46.96 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  33.55 
 
 
156 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  45 
 
 
220 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  38.46 
 
 
224 aa  95.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  42.74 
 
 
219 aa  95.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  42.74 
 
 
219 aa  95.1  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  37.58 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  40.16 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  40.48 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  42.15 
 
 
166 aa  92  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  33.75 
 
 
279 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  37.11 
 
 
161 aa  91.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  40.16 
 
 
201 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  40.32 
 
 
257 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  42.11 
 
 
153 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>