More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2803 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  98.46 
 
 		 65 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  95.38 
 
 		 65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  93.85 
 
 		 65 aa  124  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  53.85 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2595  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519025  hitchhiker  0.00116473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  55.38 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>