More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2771 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  63.6 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  60.4 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  58 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  58 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  58 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  59.68 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  56.75 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  58.89 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  52.38 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  57.2 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  53.57 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  53.88 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  56.92 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 		 249 aa  244  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  53.54 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  55.2 
 
 		 257 aa  234  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0751  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450614  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2587  short chain dehydrogenase  55.2 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2039  short chain dehydrogenase  52.89 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.08 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.52 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 267 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 254 aa  161  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 330 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 282 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.74 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.89 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  39.04 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.29 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4155  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.56 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0471031  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.97 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.33 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.74 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>