More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2733 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  815    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  72.24 
 
 		 410 aa  542  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  65.35 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  64.71 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 411 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  53.92 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 		 401 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  40.24 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 427 aa  279  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  38.74 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  39.33 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  39.9 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  39.4 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  38.74 
 
 		 419 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 420 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 451 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 420 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  41.34 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 406 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  41.09 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  37.23 
 
 		 454 aa  245  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 422 aa  245  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  39.1 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 479 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 406 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  41.73 
 
 		 455 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 406 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  39.6 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 416 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  37.91 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 		 432 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 		 432 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 416 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  36.84 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  37.74 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 416 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 416 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  38.68 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  38.04 
 
 		 421 aa  223  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  37.53 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  38.1 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  38.9 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  37.77 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 408 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 524 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  32.23 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 474 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  27.59 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>