121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2679 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2668  hypothetical protein  40 
 
 
278 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.621647  normal  0.164223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.66 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.85 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.42 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.2 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.52 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.96 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  35.88 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.28 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  29.15 
 
 
286 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  33.18 
 
 
316 aa  62.4  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 
644 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.15 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
837 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  28.12 
 
 
245 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 
1007 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  32.57 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.3 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.3 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  28.16 
 
 
245 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
246 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.19 
 
 
591 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.13 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.53 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.05 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.66 
 
 
244 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 
250 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.27 
 
 
639 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 
247 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.7 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.76 
 
 
576 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.03 
 
 
639 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.54 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05400  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  27.61 
 
 
920 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.85 
 
 
437 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  32.58 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05011  integral plasma membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09740)  25 
 
 
949 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0782168  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 
251 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50925  predicted protein  22.06 
 
 
968 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.766697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 
328 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.44 
 
 
283 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 
328 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.16 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.94 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 
348 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.78 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  36.08 
 
 
931 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.27 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.74 
 
 
262 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.22 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0240  hypothetical protein  28.77 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00126667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.14 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.47 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.88 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.42 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.24 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  25.14 
 
 
251 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.53 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.74 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.82 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>