More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2461 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  70.18 
 
 
708 aa  1022    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
713 aa  1449    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  43.88 
 
 
714 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  42.76 
 
 
742 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  42.67 
 
 
742 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  42.49 
 
 
712 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  43.29 
 
 
738 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  41.13 
 
 
737 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  41.22 
 
 
749 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 
748 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 
748 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  40.91 
 
 
711 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  40.78 
 
 
740 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 
824 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 
789 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
850 aa  220  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 
766 aa  213  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
815 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 
711 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 
707 aa  207  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 
708 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 
817 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 
837 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 
708 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
814 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 
712 aa  200  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  29.96 
 
 
689 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 
792 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.15 
 
 
709 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
710 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 
860 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 
730 aa  192  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 
721 aa  191  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.22 
 
 
713 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
708 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.94 
 
 
711 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 
706 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 
706 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 
843 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.08 
 
 
724 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 
701 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 
859 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 
825 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.97 
 
 
703 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 
701 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 
779 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 
825 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 
757 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 
723 aa  177  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 
701 aa  177  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 
733 aa  177  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.43 
 
 
706 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 
722 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.94 
 
 
708 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 
809 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 
701 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 
710 aa  174  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 
714 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
734 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 
724 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 
705 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 
701 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.46 
 
 
703 aa  172  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 
701 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 
724 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 
701 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
732 aa  170  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.94 
 
 
695 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 
710 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  26.84 
 
 
799 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 
702 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 
702 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 
829 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 
743 aa  168  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
715 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 
719 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 
714 aa  167  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
696 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 
714 aa  167  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 
701 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 
699 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 
714 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 
677 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 
706 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 
722 aa  164  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.29 
 
 
696 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 
720 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 
796 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.34 
 
 
703 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 
709 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 
698 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 
862 aa  161  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 
713 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 
778 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 
720 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 
720 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  27.04 
 
 
729 aa  160  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 
806 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
796 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 
720 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>