More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2455 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
412 aa  827    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  75.61 
 
 
424 aa  625  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.95 
 
 
414 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.95 
 
 
414 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.22 
 
 
411 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.71 
 
 
411 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.95 
 
 
414 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  70.59 
 
 
420 aa  591  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3405  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.22 
 
 
411 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02984  putative NADH oxidase-related oxidoreductase protein  71.36 
 
 
411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.476298  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  72.86 
 
 
411 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3221  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.35 
 
 
411 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.41 
 
 
418 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  71.11 
 
 
411 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.91 
 
 
418 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.63 
 
 
411 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2441  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.06 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.82 
 
 
425 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  54.92 
 
 
389 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2215  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.11 
 
 
407 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.2 
 
 
414 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4732  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.2 
 
 
416 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1170  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.59 
 
 
423 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0803  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.39 
 
 
441 aa  342  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2143  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.64 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2218  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.07 
 
 
454 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202859  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0619  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.07 
 
 
441 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2131  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.07 
 
 
441 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2021  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.1 
 
 
441 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0699  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.1 
 
 
454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1578  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.57 
 
 
441 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  41.82 
 
 
401 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3247  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.26 
 
 
435 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4571  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.99 
 
 
421 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142978  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0580  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.51 
 
 
408 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1739  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.45 
 
 
427 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  38.6 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.31 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06167  FMN binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08260)  38.07 
 
 
369 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  0.461703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  39.59 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  33.06 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.89 
 
 
376 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0697  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  32.31 
 
 
368 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00245869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  35.69 
 
 
365 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.64 
 
 
374 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.86 
 
 
374 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  31.67 
 
 
370 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.84 
 
 
366 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.77 
 
 
364 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  32.77 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.79 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.35 
 
 
386 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.07 
 
 
374 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.94 
 
 
399 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.39 
 
 
646 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2707  NADH:flavin oxidoreductase  30.7 
 
 
409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.09 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.86 
 
 
387 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  33.33 
 
 
650 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.06 
 
 
330 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.65 
 
 
654 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.67 
 
 
335 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0435  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.36 
 
 
353 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.63 
 
 
671 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.27 
 
 
329 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.53 
 
 
355 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.88 
 
 
357 aa  157  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.22 
 
 
411 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  31.2 
 
 
926 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.55 
 
 
646 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.58 
 
 
368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00242088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0472  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.71 
 
 
344 aa  153  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.59 
 
 
402 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0007  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  34.15 
 
 
368 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2937  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.29 
 
 
365 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.3 
 
 
662 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2060  NADH-dependent flavin oxidoreductase  30.15 
 
 
343 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.7 
 
 
937 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1595  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.87 
 
 
667 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01164  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.3 
 
 
680 aa  150  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  34.66 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1304  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.55 
 
 
671 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.92 
 
 
668 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1515  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.42 
 
 
686 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  30.09 
 
 
637 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03800  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
450 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1624  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.16 
 
 
423 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238661  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.51 
 
 
368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.72 
 
 
644 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2693  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.33 
 
 
363 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.91 
 
 
682 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
669 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.77 
 
 
377 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3734  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.88 
 
 
678 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.658826  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.24 
 
 
665 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0837  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.56 
 
 
377 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4270  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.44 
 
 
673 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329999  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  33.52 
 
 
368 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1344  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.79 
 
 
674 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>