292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2344 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  100 
 
 		 485 aa  978    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  70.02 
 
 		 511 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  40.84 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  30.46 
 
 		 490 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  29.61 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  31.54 
 
 		 686 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  29.51 
 
 		 512 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  29.53 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  27.98 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  28.1 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  30.21 
 
 		 666 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.37 
 
 		 680 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  28.51 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  26.82 
 
 		 672 aa  123  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  24.94 
 
 		 694 aa  113  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  27.29 
 
 		 702 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  26.96 
 
 		 585 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  28.15 
 
 		 692 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.43 
 
 		 568 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.89 
 
 		 470 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.68 
 
 		 1010 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.11 
 
 		 483 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.17 
 
 		 1005 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  25.94 
 
 		 1031 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  24.94 
 
 		 438 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.95 
 
 		 435 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.36 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  26.2 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.01 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  26.97 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.05 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.93 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.95 
 
 		 1062 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  25.06 
 
 		 819 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  26.6 
 
 		 1014 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  25.1 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.9 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.51 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.84 
 
 		 1059 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.69 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  23.87 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.07 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.27 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  23.2 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.16 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  25.74 
 
 		 540 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.68 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.46 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.91 
 
 		 1042 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.91 
 
 		 1040 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1042 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  27.41 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  26.68 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.64 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  24.72 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  24.09 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.56 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  23.13 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.15 
 
 		 1111 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.61 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.34 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.47 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  30.04 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  23.82 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.06 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  22.82 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  41.03 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  34.38 
 
 		 1084 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.33 
 
 		 407 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  36.96 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23 
 
 		 432 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  24.01 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  24.17 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  24.03 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  26.86 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  23.33 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  28.21 
 
 		 1067 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  26.47 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.71 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  28.12 
 
 		 1062 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  24.02 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  21.41 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  25 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  27.13 
 
 		 1066 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  44.79 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  36.54 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  30.43 
 
 		 1069 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  28.12 
 
 		 1062 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  27.34 
 
 		 1065 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  27.34 
 
 		 1062 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  24.83 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  28.12 
 
 		 1062 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  27.34 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  25.5 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  27.66 
 
 		 1060 aa  60.1  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  27.34 
 
 		 1062 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  26.36 
 
 		 1081 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  25.83 
 
 		 360 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  29.35 
 
 		 1062 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2387  amidohydrolase  44.44 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>