More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2289 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 719 aa  1452    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  29.28 
 
 		 848 aa  290  5.0000000000000004e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.92 
 
 		 833 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 778 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 760 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 748 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 753 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  23.28 
 
 		 720 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.35 
 
 		 750 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 734 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 733 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 713 aa  129  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 720 aa  125  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 720 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  24.28 
 
 		 691 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  28.43 
 
 		 639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 687 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  24.25 
 
 		 700 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 676 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 634 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 721 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 698 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.78 
 
 		 633 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.95 
 
 		 652 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.92 
 
 		 653 aa  98.2  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 681 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1128 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 740 aa  97.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 688 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.44 
 
 		 665 aa  95.1  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 661 aa  94.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.76 
 
 		 655 aa  94  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.42 
 
 		 656 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 650 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  21.75 
 
 		 726 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 653 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  22.87 
 
 		 665 aa  91.3  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  22.87 
 
 		 665 aa  91.3  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 649 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 648 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.56 
 
 		 668 aa  89  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 649 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 653 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 702 aa  87.8  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 657 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.22 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.22 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 649 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.22 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.12 
 
 		 659 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.22 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.22 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.22 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 680 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 799 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  36.13 
 
 		 661 aa  80.9  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.11 
 
 		 641 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.41 
 
 		 647 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 635 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 736 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 828 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 799 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 719 aa  77.8  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 707 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 706 aa  76.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 647 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 762 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  25.69 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 751 aa  72  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 699 aa  71.2  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  36.64 
 
 		 747 aa  70.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.01 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  24.12 
 
 		 646 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 799 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  34.09 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  22.22 
 
 		 665 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  22.2 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.6 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  20.13 
 
 		 668 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 757 aa  68.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 701 aa  68.2  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>