39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2205 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  100 
 
 
204 aa  405  1e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  40.78 
 
 
213 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  41.12 
 
 
202 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  40.72 
 
 
191 aa  132  4e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  30.06 
 
 
230 aa  56.2  3e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  35.86 
 
 
239 aa  56.2  4e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  26.73 
 
 
240 aa  53.9  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  40.35 
 
 
233 aa  53.5  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  28.74 
 
 
226 aa  52  5e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  26 
 
 
247 aa  51.6  8e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.94 
 
 
254 aa  51.6  9e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  33.91 
 
 
227 aa  49.7  3e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  38.1 
 
 
240 aa  49.3  4e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  39.29 
 
 
199 aa  48.9  5e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  30.16 
 
 
204 aa  48.9  6e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  39.34 
 
 
225 aa  48.5  6e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  38.71 
 
 
227 aa  48.5  6e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  44.44 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  34.53 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  40 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  31.34 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85542e-07 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  35.82 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  35.82 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  39.29 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  35.82 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  30.98 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  33.82 
 
 
229 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  35.48 
 
 
231 aa  44.7  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  36.84 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  33.9 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  33.33 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  26.4 
 
 
211 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>