32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2176 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  53.28 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  47.76 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  45.52 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  45.11 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  47.54 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  38.52 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  37.31 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  33.57 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  33.57 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  33.57 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  29.58 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  29.85 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  29.29 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  38.36 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  29.69 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  25.87 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  28.91 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  27.61 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  26.43 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  29.1 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6198  hypothetical protein  30.77 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  27.21 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  28.26 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  25.49 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  24.81 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>