More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1982 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  100 
 
 		 328 aa  679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  96.23 
 
 		 323 aa  631  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  92.01 
 
 		 322 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  92.01 
 
 		 322 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  89.21 
 
 		 332 aa  594  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  83.39 
 
 		 321 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  83.39 
 
 		 321 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  73.1 
 
 		 317 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  73.33 
 
 		 317 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  70.79 
 
 		 318 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  71.61 
 
 		 317 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  70.98 
 
 		 317 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  70.16 
 
 		 318 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  71.02 
 
 		 316 aa  474  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  70.98 
 
 		 317 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  70.44 
 
 		 319 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  70.98 
 
 		 317 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  71.29 
 
 		 317 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  69.52 
 
 		 316 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  70.48 
 
 		 316 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  70.25 
 
 		 319 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  70.32 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  69.75 
 
 		 317 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  70.7 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  71.97 
 
 		 319 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  70.03 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  70.03 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  69.62 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  68.57 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  71.66 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  71.02 
 
 		 316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  70.03 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  66.87 
 
 		 342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  69.06 
 
 		 321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  71.02 
 
 		 316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  70.03 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  70.03 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  70.98 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  73.55 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 319 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  69.11 
 
 		 316 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  68.25 
 
 		 314 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  70.35 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  70.98 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 340 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  67.09 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  71.34 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  67.41 
 
 		 317 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  66.67 
 
 		 340 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  68.91 
 
 		 316 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  67.63 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  70.06 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  67.51 
 
 		 323 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  67.82 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  68.99 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  68.99 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  68.99 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  67.09 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 318 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  69.11 
 
 		 316 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  67.41 
 
 		 317 aa  454  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  68.04 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  67.09 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  68.99 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  67.09 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  68.99 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  70.38 
 
 		 315 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  68.35 
 
 		 315 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  67.72 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  67.72 
 
 		 316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  67.72 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  67.72 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  67.71 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  68.04 
 
 		 318 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  68.05 
 
 		 316 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  69.87 
 
 		 328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  67.72 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  68.57 
 
 		 318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  68.35 
 
 		 320 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 321 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  67.51 
 
 		 320 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  66.77 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  67.2 
 
 		 319 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  65.82 
 
 		 320 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  66.56 
 
 		 322 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  68.79 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  66.98 
 
 		 333 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  70 
 
 		 314 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  67.19 
 
 		 321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  65.82 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  65.82 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  67.52 
 
 		 316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  66.03 
 
 		 333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  68.47 
 
 		 316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>