More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1949 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.92 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.92 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 235 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59770  putative two component response regulator  34.12 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114482  hitchhiker  1.6476100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  33.49 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  28.57 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  35.35 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3018  LuxR family DNA-binding response regulator  35.5 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  34.36 
 
 		 265 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  31.47 
 
 		 216 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  29.9 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  31.47 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  28.43 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  28.43 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  30.73 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  29.38 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.01 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  30.14 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  27.41 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  31.12 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.69 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  28.91 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  29.61 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  30.46 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  32.5 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  32.5 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  32 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  26.96 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  32.5 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  28.43 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  29.27 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  31.31 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  29.38 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.44 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  29.65 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  33.01 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  30.73 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  30.58 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141427  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  29.9 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12543  Transcriptional regulator  28.23 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204025  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.02 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  31.1 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>