More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1943 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  50.2 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  49.61 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  48.82 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  48.62 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  47.76 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  53.75 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  41.63 
 
 		 455 aa  188  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50.41 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  46.94 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  47.22 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  44.77 
 
 		 270 aa  184  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  47.41 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.3 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  42.13 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  50.2 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  44.12 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  40.81 
 
 		 416 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42 
 
 		 414 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  48.74 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  45.9 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  43.28 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  45.64 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  37.26 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  42.57 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  44.54 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  44.62 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.34 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  43.91 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  43.17 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  42.37 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  41.86 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 288 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  39.17 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  39.92 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  39.36 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40.64 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  38.19 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.08 
 
 		 424 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  41.15 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  42.39 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.73 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.95 
 
 		 418 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  42.02 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  43.94 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  41.84 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  41.32 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  37.94 
 
 		 424 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.32 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  42.92 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.06 
 
 		 405 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  41.32 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  37.01 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 536 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  42.59 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  41.37 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.44 
 
 		 272 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  39.37 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  41.6 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>