132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1940 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  905    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2566  hypothetical protein  52.16 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0965859  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  46.2 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  35.79 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  26.83 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  26.83 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  26.52 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  26.52 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  26.22 
 
 		 353 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  25.61 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  25.61 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  25.53 
 
 		 353 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  25.61 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  25.53 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  25.3 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  28.33 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  22.75 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  24.5 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  25.61 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.94 
 
 		 752 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  23.31 
 
 		 356 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  28.15 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  24.77 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  26.07 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.11 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.51 
 
 		 1094 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.55 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.47 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0979  hypothetical protein  26.15 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.24 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1704  hypothetical protein  22.34 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  25.73 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25 
 
 		 1667 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.89 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.89 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.89 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.44 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  32.86 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.96 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.15 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.8 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  28.42 
 
 		 819 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.73 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.69 
 
 		 324 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.16 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  34.71 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  28.29 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.08 
 
 		 154 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  25.58 
 
 		 325 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.34 
 
 		 335 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.53 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.75 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  23.87 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.9 
 
 		 607 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.2 
 
 		 943 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.72 
 
 		 327 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29 
 
 		 239 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.67 
 
 		 479 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.73 
 
 		 689 aa  50.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.15 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  22.42 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.17 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1767  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.41 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.51 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.66 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  26.72 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.21 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  23.41 
 
 		 250 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  28.45 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  30.89 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  27.08 
 
 		 827 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.82 
 
 		 348 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  22.99 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2626  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.72 
 
 		 659 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0114  hypothetical protein  25.08 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.715385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  28.08 
 
 		 346 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  31.39 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.74 
 
 		 330 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5257  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.69 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.96 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.79 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.65 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 		 818 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.82 
 
 		 2114 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4957  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.85 
 
 		 1349 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.83 
 
 		 305 aa  46.6  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  28.08 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  26.06 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  27.37 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.02 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.87 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.96 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.13 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.41 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>