More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1894 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1894  flagellin  100 
 
 
395 aa  773    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  77.86 
 
 
392 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  67.55 
 
 
405 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  57.39 
 
 
390 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  57.39 
 
 
390 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  54.21 
 
 
388 aa  358  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  52.14 
 
 
404 aa  332  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  50.96 
 
 
404 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  44.56 
 
 
497 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  45.66 
 
 
437 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  43.49 
 
 
488 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  46.88 
 
 
387 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  43.81 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  45.18 
 
 
398 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  44.91 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  47.88 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  41.71 
 
 
384 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  42.64 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  41.63 
 
 
377 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  42.96 
 
 
377 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  42.72 
 
 
378 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  41.63 
 
 
377 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  41.04 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  42.39 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  44.08 
 
 
379 aa  269  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  40.98 
 
 
384 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  40.08 
 
 
488 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  44.01 
 
 
393 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  41.13 
 
 
377 aa  266  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  41.21 
 
 
376 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  43.77 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  39.22 
 
 
484 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  41.29 
 
 
377 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  40.89 
 
 
378 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  41.29 
 
 
377 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  40.89 
 
 
377 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  38.81 
 
 
485 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  41.77 
 
 
379 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  40.81 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  40.81 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  40.81 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  38.85 
 
 
375 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  40.81 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  41.46 
 
 
376 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  40.81 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  40.81 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  40.81 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  43.99 
 
 
412 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  40.69 
 
 
377 aa  253  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  43.07 
 
 
369 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  43.07 
 
 
369 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  41.4 
 
 
384 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  41.4 
 
 
384 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  40.96 
 
 
383 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  59.58 
 
 
609 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  42.48 
 
 
390 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  42.04 
 
 
376 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  37 
 
 
385 aa  239  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  39.95 
 
 
356 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0103  flagellin  40.78 
 
 
381 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  41.52 
 
 
380 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  39.16 
 
 
387 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  54.18 
 
 
462 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  38.24 
 
 
387 aa  229  7e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2998  flagellin domain protein  39.76 
 
 
391 aa  229  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  36.29 
 
 
498 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  55.42 
 
 
501 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  68.42 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  53.82 
 
 
486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  37.81 
 
 
389 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  36.73 
 
 
374 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  38.05 
 
 
383 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  72.61 
 
 
492 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  67.82 
 
 
472 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  73.89 
 
 
492 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  38.16 
 
 
420 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  54.29 
 
 
493 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  37.82 
 
 
327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  35.46 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  39.42 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  67.84 
 
 
471 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  57.28 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  51.69 
 
 
506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  63.01 
 
 
475 aa  209  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  62.43 
 
 
475 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  39.21 
 
 
404 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  43.79 
 
 
505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  43.3 
 
 
505 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  51.24 
 
 
469 aa  196  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  47.74 
 
 
492 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  52.89 
 
 
494 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  57.07 
 
 
412 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  59.88 
 
 
276 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  55.73 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.75 
 
 
271 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.75 
 
 
271 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  55.43 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  55.68 
 
 
580 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  58.49 
 
 
272 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  58.49 
 
 
272 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>