More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1757 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
431 aa  845    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  79.35 
 
 
431 aa  624  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  74.42 
 
 
431 aa  592  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  73.72 
 
 
431 aa  588  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  60.32 
 
 
439 aa  484  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
443 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
443 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
443 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
434 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  53.47 
 
 
434 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  53.47 
 
 
434 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 
431 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
434 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  53.47 
 
 
434 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  53.01 
 
 
434 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  53.15 
 
 
443 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  53.01 
 
 
434 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  50.47 
 
 
434 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  52.46 
 
 
438 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  52.31 
 
 
434 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 
434 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  52.78 
 
 
434 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
436 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
431 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
430 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
436 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  52.08 
 
 
434 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  52.08 
 
 
434 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  51.85 
 
 
434 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  52.19 
 
 
435 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  53.64 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  51.85 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 
435 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  52.35 
 
 
442 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  48.54 
 
 
429 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  52.11 
 
 
442 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  50 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  50.35 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  52.78 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  50.46 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  53.49 
 
 
429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  46.62 
 
 
427 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  52.24 
 
 
852 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
433 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  49.54 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  49.2 
 
 
438 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
433 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  50.97 
 
 
428 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 
442 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 
439 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  49.31 
 
 
433 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  47.22 
 
 
429 aa  393  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  48.73 
 
 
429 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  48.48 
 
 
435 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 
433 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  47.34 
 
 
438 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  51.19 
 
 
429 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  49.52 
 
 
422 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  47.5 
 
 
430 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  52.88 
 
 
429 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  47.22 
 
 
428 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  46.76 
 
 
428 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  46.28 
 
 
428 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  49.05 
 
 
867 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  48.33 
 
 
867 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  45.45 
 
 
426 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  44.84 
 
 
431 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  44.6 
 
 
431 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  45.2 
 
 
433 aa  346  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  42.62 
 
 
434 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  45.12 
 
 
430 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 
433 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  43.35 
 
 
427 aa  340  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  42.19 
 
 
429 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  45.45 
 
 
426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  43.07 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  41.92 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  41.92 
 
 
429 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
429 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
436 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
429 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  44.9 
 
 
426 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  45.5 
 
 
429 aa  332  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  41.55 
 
 
429 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  41.55 
 
 
429 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  41.55 
 
 
429 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  41.31 
 
 
429 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  46.62 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  42.36 
 
 
429 aa  329  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
427 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  44.86 
 
 
426 aa  327  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 
434 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  44.44 
 
 
439 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  43.84 
 
 
429 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  45.14 
 
 
416 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  41.73 
 
 
432 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  46.44 
 
 
424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>