242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1689 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 192 aa  217  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 193 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  31.76 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  30.11 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 187 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  29.65 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  23.76 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  21.14 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 600 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 424 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 346 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
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NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
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