More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1632 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  55.92 
 
 
631 aa  641  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  51.1 
 
 
632 aa  647  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  53.17 
 
 
623 aa  639  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  53.69 
 
 
643 aa  640  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  75.96 
 
 
639 aa  896  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  75.48 
 
 
623 aa  892  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  81.43 
 
 
615 aa  952  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  100 
 
 
627 aa  1265  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  51.72 
 
 
642 aa  644  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  50.79 
 
 
640 aa  633  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  50.39 
 
 
637 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  50.39 
 
 
637 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  50.39 
 
 
637 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  53.03 
 
 
650 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 
637 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.14394e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  51.17 
 
 
640 aa  625  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  51.33 
 
 
640 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  50.32 
 
 
639 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  51.89 
 
 
635 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17313e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  50.55 
 
 
640 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  49.61 
 
 
638 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  50.16 
 
 
639 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  50.31 
 
 
641 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  50.31 
 
 
641 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  50.31 
 
 
641 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  50.31 
 
 
641 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  48.34 
 
 
647 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
641 aa  612  1e-174  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  51.02 
 
 
640 aa  613  1e-174  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  50.32 
 
 
634 aa  613  1e-174  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  4.34555e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  52.29 
 
 
641 aa  613  1e-174  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.59167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  50.46 
 
 
649 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  49.46 
 
 
653 aa  611  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 
633 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  53.3 
 
 
637 aa  605  1e-172  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 
646 aa  605  1e-172  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  51.58 
 
 
641 aa  607  1e-172  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  51.63 
 
 
641 aa  606  1e-172  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  50 
 
 
639 aa  603  1e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  50.24 
 
 
635 aa  604  1e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.10719e-06  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  54.04 
 
 
628 aa  602  1e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  48.74 
 
 
635 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  49.76 
 
 
626 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 
632 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  49.45 
 
 
638 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  52.64 
 
 
642 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  50.55 
 
 
642 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  50 
 
 
649 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  49.92 
 
 
645 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  50.23 
 
 
637 aa  597  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  49.68 
 
 
635 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  50 
 
 
661 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  49.69 
 
 
649 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  49.84 
 
 
649 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  50.08 
 
 
641 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  50 
 
 
661 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  48.66 
 
 
639 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  50.31 
 
 
649 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  50.32 
 
 
636 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49.84 
 
 
635 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
635 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  48.58 
 
 
638 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  49.14 
 
 
640 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.65711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  49.37 
 
 
635 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  52.48 
 
 
642 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  49.37 
 
 
635 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  50.71 
 
 
636 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  49.37 
 
 
635 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
635 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.77813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
639 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.85056e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  49.84 
 
 
635 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  49.37 
 
 
635 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  49.84 
 
 
635 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  52.33 
 
 
642 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 
642 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
648 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  49.69 
 
 
642 aa  585  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  49.06 
 
 
636 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
660 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
660 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  52.88 
 
 
594 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
635 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.87784e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  50.55 
 
 
663 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  49.21 
 
 
635 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
660 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
648 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
648 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 
635 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  49.45 
 
 
640 aa  585  1e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  45.98 
 
 
645 aa  583  1e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
638 aa  583  1e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
1065 aa  585  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  50.08 
 
 
625 aa  584  1e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  49.61 
 
 
645 aa  583  1e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  53.14 
 
 
636 aa  582  1e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  50.08 
 
 
631 aa  580  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
648 aa  581  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  48.64 
 
 
617 aa  581  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  50.55 
 
 
636 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  49.68 
 
 
629 aa  577  1e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>