More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1628 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
187 aa  367  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 
186 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  52.73 
 
 
172 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
177 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  54.43 
 
 
170 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
184 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
174 aa  168  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
172 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
181 aa  164  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1169  adenine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0215372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  52.9 
 
 
175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  53.75 
 
 
176 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
185 aa  160  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  160  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
185 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
179 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 
173 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
172 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
190 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
172 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
174 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
198 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
178 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
181 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
181 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
179 aa  158  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
184 aa  158  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
171 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
182 aa  157  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
181 aa  157  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
187 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
178 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
175 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
187 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
179 aa  155  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
187 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  51.95 
 
 
177 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
168 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
188 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
183 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
184 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
183 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
172 aa  155  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 
181 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  51.95 
 
 
187 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
172 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
181 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
181 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
205 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
183 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
179 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
180 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
181 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
171 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
184 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
184 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
179 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
184 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
180 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
184 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
199 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
182 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
182 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
170 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
181 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
170 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
170 aa  151  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
183 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
216 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
170 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  44.15 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>