298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1616 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
114 aa  230  4e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  70.09 
 
 
117 aa  148  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  60.34 
 
 
120 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  60.34 
 
 
120 aa  141  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  49.53 
 
 
168 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  51.96 
 
 
109 aa  113  1e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  49.11 
 
 
123 aa  112  2e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  50.93 
 
 
108 aa  112  2e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 
109 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  50.93 
 
 
110 aa  111  4e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  50.93 
 
 
110 aa  111  4e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  109  1e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  108  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  108  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  108  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  55.91 
 
 
108 aa  108  2e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  108  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  108  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  108  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  50.94 
 
 
108 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  50.94 
 
 
108 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  57.65 
 
 
109 aa  106  8e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  55.42 
 
 
109 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  54.55 
 
 
114 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  50.94 
 
 
120 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  48.04 
 
 
120 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  48.04 
 
 
109 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  53.33 
 
 
108 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  54.65 
 
 
108 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  49.44 
 
 
108 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  51.72 
 
 
91 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  50.56 
 
 
127 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  45.28 
 
 
108 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.08918e-08  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  45.87 
 
 
109 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  49.06 
 
 
108 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  46.81 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  52.87 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 
109 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.98451e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  45.98 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  45.56 
 
 
93 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  47.67 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  46.67 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  42.99 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  47.67 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  49.46 
 
 
111 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  47.67 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  52.63 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.75528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36476e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  52.63 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.00527e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  49.47 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  43.52 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  47.06 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  47 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  43.48 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  43.48 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.98712e-08  hitchhiker  6.23922e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.13492e-06  hitchhiker  7.20992e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.18136e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  4.16487e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.42137e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  47.52 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  41.44 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05955e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.29003e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 
114 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  48.19 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2351  preprotein translocase subunit, YajC  44.04 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  40.86 
 
 
106 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  38.53 
 
 
111 aa  87  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  38.18 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  38.18 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>