More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1503 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  597  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00136  transcriptional regulator  67 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0939848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 300 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5596  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 302 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5712  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5812  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394289  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  48.17 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 312 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1835  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 300 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7006  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245056 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7036  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 302 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753996  normal  0.202987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1459  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6369  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1489  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6340  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2580  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.64734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  54.11 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4371  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120427  normal  0.0114569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4888  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842782  hitchhiker  0.000000597964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0901  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2209  transcriptional regulator transcription regulator protein  48.3 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852985  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2013  transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.706751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2407  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0852  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0564501  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.6 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  43.6 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0207  transcriptional regulator, LysR family protein  38.14 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1217  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1625  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.27656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2629  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0897024  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2306  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1642  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0837368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1367  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.780274  hitchhiker  0.00766256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2658  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4846  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.3 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3154  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2566  transcriptional regulator, LysR family protein  41.11 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.169801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1388  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.837907  normal  0.0605197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2296  LysR substrate binding domain protein  42.96 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2247  LysR substrate binding domain protein  42.96 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160886  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2406  LysR substrate binding domain-containing protein  42.96 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2193  LysR substrate binding domain protein  42.96 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.453125  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2294  LysR substrate binding domain-containing protein  42.96 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0349652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4168  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0180003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1739  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1675  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3695  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2890  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3009  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1432  transcriptional regulator, MarR family  41.78 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3477  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.496737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3124  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3250  MarR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3030  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.503722  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4099  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4267  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287329  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2902  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 319 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.374405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  36.24 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0689  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4110  transcriptional regulator, MarR family  41.02 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3997  transcriptional regulator, MarR family  41.02 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1784  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1984  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1907  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2932  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 317 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0518  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03709  putative conserved protein  36.18 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4196  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0736  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.54796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03658  hypothetical protein  36.18 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4047  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.900544  normal  0.0449817 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00415  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3032  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.78 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0518  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002036  hypothetical protein  34.34 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3558  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2194  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.24 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.431967  hitchhiker  0.00000655137 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3403  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0596  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3295  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1175  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02925  hypothetical protein  39.46 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3580  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>