More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1474 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  75.22 
 
 
558 aa  839    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
561 aa  1113    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  57.73 
 
 
584 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  58.28 
 
 
582 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  57.24 
 
 
582 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  54.74 
 
 
560 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  53.85 
 
 
559 aa  618  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  56.42 
 
 
582 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  54.66 
 
 
581 aa  612  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  55 
 
 
581 aa  601  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  56.86 
 
 
592 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.25 
 
 
559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  52.75 
 
 
591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  49.29 
 
 
568 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.41 
 
 
559 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.35 
 
 
561 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  37.05 
 
 
561 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  40.9 
 
 
544 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  40.58 
 
 
543 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  37.61 
 
 
560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.91 
 
 
561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  37.61 
 
 
560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  41.08 
 
 
544 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.48 
 
 
563 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  41.33 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  41.33 
 
 
543 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  41.68 
 
 
560 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  38.21 
 
 
565 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  32.6 
 
 
564 aa  365  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  41.54 
 
 
546 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  37.5 
 
 
599 aa  363  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  35.13 
 
 
558 aa  356  6.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.55 
 
 
559 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.58 
 
 
559 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  37.67 
 
 
586 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.33 
 
 
558 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  36.58 
 
 
547 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  33.33 
 
 
558 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.05 
 
 
559 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.47 
 
 
558 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  34.88 
 
 
556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.78 
 
 
557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  33.46 
 
 
552 aa  337  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.04 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  41.14 
 
 
556 aa  323  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  35.2 
 
 
551 aa  323  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.14 
 
 
554 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  33.45 
 
 
557 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.59 
 
 
501 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.14 
 
 
558 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  37.2 
 
 
552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.12 
 
 
555 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.53 
 
 
562 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  35.27 
 
 
557 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  35.27 
 
 
557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.05 
 
 
557 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  33.27 
 
 
555 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.5 
 
 
557 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.27 
 
 
559 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.1 
 
 
558 aa  294  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.39 
 
 
549 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.47 
 
 
558 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.66 
 
 
565 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.66 
 
 
565 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  36.91 
 
 
560 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.97 
 
 
553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.69 
 
 
571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  35.8 
 
 
550 aa  283  7.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  35.22 
 
 
558 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  38.34 
 
 
544 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.83 
 
 
573 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.21 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  31.28 
 
 
549 aa  274  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  30.73 
 
 
549 aa  274  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  32.85 
 
 
556 aa  273  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.26 
 
 
557 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  32.68 
 
 
549 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  34.24 
 
 
542 aa  272  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.78 
 
 
537 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  33.26 
 
 
582 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  30.55 
 
 
549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.56 
 
 
553 aa  270  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.73 
 
 
547 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.27 
 
 
509 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.07 
 
 
578 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  29.6 
 
 
537 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.59 
 
 
546 aa  266  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.43 
 
 
506 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.9 
 
 
522 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  32.72 
 
 
553 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.35 
 
 
563 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.11 
 
 
585 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  40.14 
 
 
538 aa  263  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.56 
 
 
552 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.86 
 
 
552 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.31 
 
 
547 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.67 
 
 
525 aa  261  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  30.47 
 
 
547 aa  260  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  30.17 
 
 
586 aa  259  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.43 
 
 
549 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>