More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1421 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  60.37 
 
 
285 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 
285 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
289 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  43.91 
 
 
276 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
306 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  43.17 
 
 
273 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 
293 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 
279 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
273 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
281 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
275 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
295 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
295 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
300 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
295 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 
319 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  39.49 
 
 
281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 
247 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 
247 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
289 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
270 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 
300 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  31.91 
 
 
292 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2035  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 
243 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 
331 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4179  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
299 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
199 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  31.83 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 
348 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
311 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 
309 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 
315 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
303 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 
301 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
330 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.55 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
311 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  40.52 
 
 
323 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 
349 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
319 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 
297 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  49.12 
 
 
124 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 
328 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  37.57 
 
 
318 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
313 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 
329 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
305 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  40.67 
 
 
305 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 
325 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 
214 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 
318 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  39.49 
 
 
305 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 
325 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 
322 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 
318 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  36.93 
 
 
308 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1450  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 
301 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
295 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 
320 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 
356 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 
320 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 
305 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 
322 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 
301 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 
301 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 
308 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 
304 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
310 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
325 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
325 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  39.07 
 
 
345 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 
309 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 
301 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
320 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.6 
 
 
356 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
299 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  39.07 
 
 
332 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>