54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1417 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  61.42 
 
 
256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  56.08 
 
 
256 aa  278  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  46.74 
 
 
291 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  50 
 
 
269 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  47.45 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  46.46 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  46.06 
 
 
267 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  43.37 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  40.16 
 
 
276 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  39.76 
 
 
271 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  39.36 
 
 
271 aa  175  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  39.47 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  36.08 
 
 
256 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  37.55 
 
 
263 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  36.08 
 
 
267 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  34.85 
 
 
265 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  30.31 
 
 
262 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  30.31 
 
 
270 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  30.31 
 
 
270 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  29.92 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  35.02 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  32.95 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  32.68 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  32.81 
 
 
276 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  29.92 
 
 
269 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  33.2 
 
 
270 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  32.93 
 
 
264 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  28.69 
 
 
280 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  31.66 
 
 
262 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  27.59 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  30.5 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  28.51 
 
 
257 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  27.38 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  27.34 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  25.97 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  28.51 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  30.08 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  30.08 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  30.08 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  27.31 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  27.38 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  27.38 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  27.38 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  26.32 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  26.17 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  25.38 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  22.67 
 
 
277 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>