More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1352 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  100 
 
 
161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  76.88 
 
 
161 aa  263  5e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  76.88 
 
 
161 aa  263  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  86.86 
 
 
137 aa  247  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  61.54 
 
 
160 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  61.54 
 
 
168 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  58.06 
 
 
162 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  59.6 
 
 
171 aa  170  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  56.58 
 
 
149 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  62.75 
 
 
166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  49.36 
 
 
158 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  52.63 
 
 
153 aa  158  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  50.32 
 
 
157 aa  158  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  52.15 
 
 
189 aa  157  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  60.56 
 
 
157 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  48.43 
 
 
158 aa  157  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  55.26 
 
 
149 aa  156  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  49.04 
 
 
156 aa  156  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  51.97 
 
 
154 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  58.27 
 
 
151 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  50 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  52.08 
 
 
157 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  52.08 
 
 
157 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  54.19 
 
 
166 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  52.08 
 
 
157 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  51.28 
 
 
157 aa  153  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  52.08 
 
 
157 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  52.08 
 
 
157 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  49.07 
 
 
161 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  49.03 
 
 
149 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  59.86 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  59.86 
 
 
157 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  62.69 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  49.04 
 
 
156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  50 
 
 
161 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  55.77 
 
 
164 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  51.41 
 
 
154 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  50.66 
 
 
152 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  56.83 
 
 
166 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  55.26 
 
 
153 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  53.96 
 
 
154 aa  148  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  49.65 
 
 
154 aa  148  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  56.74 
 
 
154 aa  147  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  52.9 
 
 
158 aa  147  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  48.08 
 
 
154 aa  146  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  48.72 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  48.72 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  50.64 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  48.39 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  46.79 
 
 
154 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  54.17 
 
 
155 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  54.17 
 
 
155 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  54.17 
 
 
155 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  54.17 
 
 
155 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  46.25 
 
 
158 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  54.17 
 
 
155 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.14 
 
 
245 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  54.17 
 
 
155 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  53.47 
 
 
155 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  53.47 
 
 
155 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  53.47 
 
 
155 aa  140  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  54.11 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  52.6 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  46.05 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  51.33 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  51.95 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  52.6 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  51.95 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  52.6 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  60 
 
 
274 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  54.2 
 
 
152 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  52.6 
 
 
153 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  52.08 
 
 
155 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.84 
 
 
270 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  54.23 
 
 
152 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  51.95 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  53.85 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  51.95 
 
 
153 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.84 
 
 
270 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  134  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  43.12 
 
 
155 aa  133  8e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  50.66 
 
 
147 aa  133  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.36 
 
 
255 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  47.1 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  50.64 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  43.14 
 
 
152 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  43.14 
 
 
152 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  48.68 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  48.61 
 
 
161 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  53.96 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  48.15 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  51.72 
 
 
151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  48.72 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  51.75 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  51.75 
 
 
152 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  48.08 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  50.64 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.5 
 
 
258 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  53.39 
 
 
168 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.28 
 
 
258 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>