126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1305 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  587  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  70.52 
 
 
279 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  67.79 
 
 
277 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  67.78 
 
 
281 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  67.04 
 
 
277 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  66.79 
 
 
277 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  66.05 
 
 
276 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  59.55 
 
 
283 aa  325  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  56.2 
 
 
278 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  59.71 
 
 
283 aa  322  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  56.41 
 
 
289 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  56.62 
 
 
289 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  56.41 
 
 
289 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2641  hypothetical protein  63.12 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  61.36 
 
 
280 aa  318  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  56.02 
 
 
288 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  54.37 
 
 
278 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  53.61 
 
 
283 aa  311  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  54.1 
 
 
300 aa  311  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  55.85 
 
 
278 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  51.24 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  54.2 
 
 
279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  52.85 
 
 
278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  53.38 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  53.01 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  53.38 
 
 
282 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  55.09 
 
 
281 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  51.46 
 
 
287 aa  300  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  50 
 
 
283 aa  298  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  59.32 
 
 
284 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  53.82 
 
 
279 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  58.17 
 
 
284 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  57.25 
 
 
282 aa  290  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  53.65 
 
 
280 aa  285  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  47.12 
 
 
367 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  49.24 
 
 
277 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  45.11 
 
 
301 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  41.7 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  41.33 
 
 
293 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  43.85 
 
 
279 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  40.46 
 
 
305 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  41.35 
 
 
278 aa  191  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  39.26 
 
 
299 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  43.02 
 
 
278 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  38.89 
 
 
299 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  39.26 
 
 
299 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  39.26 
 
 
299 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  38.31 
 
 
287 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  37.93 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  40.39 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  39.64 
 
 
316 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  42.31 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  40.08 
 
 
319 aa  178  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  37.55 
 
 
287 aa  178  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  42.65 
 
 
277 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  42.31 
 
 
277 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  39.35 
 
 
285 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  38.75 
 
 
290 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  43.77 
 
 
277 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  39.1 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  38.21 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  38.28 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  40.77 
 
 
283 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  43.24 
 
 
278 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  36.47 
 
 
292 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  38.2 
 
 
313 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  35.74 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  38.49 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  39.85 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  37.14 
 
 
303 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  37.14 
 
 
293 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  37.16 
 
 
307 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  39.56 
 
 
300 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  40.84 
 
 
276 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  37.26 
 
 
311 aa  158  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  35.71 
 
 
308 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  37.13 
 
 
308 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  35.93 
 
 
289 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  35.45 
 
 
300 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  33.58 
 
 
292 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  34.7 
 
 
295 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  36.47 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  34.8 
 
 
292 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  35.93 
 
 
290 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  35.5 
 
 
290 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  34.41 
 
 
339 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  35.09 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  35.09 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  37.55 
 
 
286 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  36.68 
 
 
320 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  33.72 
 
 
298 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  34.78 
 
 
296 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  36.43 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  28.46 
 
 
289 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  31.32 
 
 
284 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  35.95 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  33.46 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.019618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>