More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1263 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  86.61 
 
 		 240 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  82.08 
 
 		 243 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  82.28 
 
 		 243 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  66.95 
 
 		 242 aa  331  8e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  68.51 
 
 		 243 aa  325  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  66.24 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  64.56 
 
 		 242 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  64.83 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  60 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  64.41 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.33 
 
 		 274 aa  298  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  58.4 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  60.26 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  57.98 
 
 		 239 aa  291  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  58.82 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  59.49 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  58.23 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  57.98 
 
 		 239 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  57.81 
 
 		 246 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  56.84 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  57.81 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  61.54 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  60.58 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  60.58 
 
 		 251 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  60.83 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  62.93 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.75 
 
 		 245 aa  287  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  58.55 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  58.4 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  62.07 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  58.55 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  58.97 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  62.07 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  62.07 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  62.5 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  58.23 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  59.92 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  58.23 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  61.43 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  62.5 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  57.5 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  58.4 
 
 		 239 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.84 
 
 		 235 aa  285  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  62.5 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  57.74 
 
 		 245 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  57.56 
 
 		 239 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  61.3 
 
 		 241 aa  284  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  58.23 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  58.23 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  58.23 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  58.23 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  61.64 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  59.07 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  58.23 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  58.8 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  59.48 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  59.4 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  59.91 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  59.15 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  58.65 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  58.65 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  54.7 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  60.68 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  58.23 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  57.69 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  60.78 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  59.83 
 
 		 236 aa  281  5.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  61.21 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  59.57 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  56.72 
 
 		 238 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  57.14 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  57.56 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  60.78 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  57.38 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  59.32 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  56.54 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  58.37 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  55.79 
 
 		 242 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  59.92 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  58.72 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  58.72 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  55.56 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  58.3 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  58.8 
 
 		 237 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  57.87 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.58 
 
 		 238 aa  277  8e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  57.26 
 
 		 244 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>