More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1260 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
278 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  65.96 
 
 
284 aa  321  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  65.61 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  70.8 
 
 
270 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
282 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
282 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
282 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44.57 
 
 
285 aa  195  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  44.2 
 
 
285 aa  195  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  44.2 
 
 
285 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
285 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.36 
 
 
282 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.84 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.84 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.84 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.84 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.84 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.39 
 
 
285 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  41.67 
 
 
285 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  42.03 
 
 
285 aa  178  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 
271 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  45.42 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.36 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  41.64 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  41.52 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
268 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  39.15 
 
 
271 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  38.95 
 
 
285 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  41.39 
 
 
268 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 
283 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  37.41 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  39.42 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 
280 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
287 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
287 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  35.51 
 
 
284 aa  157  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
285 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  41.16 
 
 
267 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  36.52 
 
 
285 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
285 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  35.92 
 
 
287 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  36.52 
 
 
285 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  35.14 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
271 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
271 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
271 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
271 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  38.63 
 
 
279 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 
273 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
271 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  38.43 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  37.4 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  38.38 
 
 
276 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 
274 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 
275 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  38.91 
 
 
271 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  37.81 
 
 
328 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  39.54 
 
 
276 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  35.09 
 
 
285 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  42.71 
 
 
269 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  37.74 
 
 
261 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  53.54 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  54.84 
 
 
268 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  35.82 
 
 
275 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  38.03 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  34.52 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  48.47 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
259 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 
281 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 
281 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  34.86 
 
 
275 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  39.3 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  43.53 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  47.73 
 
 
279 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  30.47 
 
 
281 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
273 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  51.97 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  49.59 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  49.02 
 
 
319 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>