124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1230 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  100 
 
 		 386 aa  767    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  64.42 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  65.45 
 
 		 386 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  61.56 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  62.03 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  60.21 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  60 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  59.74 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  59.95 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  59.95 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  59.23 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  57.91 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  59.49 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  59.49 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  60.98 
 
 		 387 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  58.02 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  58.42 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  60.1 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  60.21 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  60.1 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  60.1 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  60 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  61.7 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  61.7 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  60.15 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  61.7 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  61.7 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  61.7 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  61.7 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  61.7 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  61.44 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  62.63 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  62.63 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  53.96 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  62.37 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  62.37 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  59.54 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  62.37 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  62.37 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  60.05 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  52.69 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  56.19 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  53.75 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  53.87 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  52.93 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  54.73 
 
 		 388 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  51.14 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  51.14 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  51.14 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  50.38 
 
 		 388 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  50.25 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  45.1 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  40.53 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  42.18 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  42.75 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  39.26 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  38.95 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  39.49 
 
 		 384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  38.66 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.2 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.89 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.97 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.68 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.68 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.25 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.89 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.18 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.66 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  29.71 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.2 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.34 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  26.12 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.26 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  24.27 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  24.56 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  25.89 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  24.15 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  26.3 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  23.84 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  24.66 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  26.36 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.36 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.46 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.64 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.91 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.24 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.74 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.17 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  63.16 
 
 		 84 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.28 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.28 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  43.37 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  42.53 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  27.04 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.81 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.67 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.16 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  23.71 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  22.54 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.56 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>