272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1208 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  100 
 
 		 525 aa  1083    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  50.19 
 
 		 552 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  44.89 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  41.51 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  40.28 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  30.35 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  27.62 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  26.15 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  26.35 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  27.61 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  26.02 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  27.92 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  27.05 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  29.25 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  26.55 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  27.92 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  27.42 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  26.88 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  26.08 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  27.55 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  26.65 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.18 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  26.44 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  25.48 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  31.45 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  25.97 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  26.31 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  27.12 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  27.1 
 
 		 458 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  26.63 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  25.2 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  27.3 
 
 		 580 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.22 
 
 		 497 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  28.62 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  24.9 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  24.73 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  23.12 
 
 		 460 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  28.28 
 
 		 743 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  26.67 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  23.19 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  31.96 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  46.91 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  26.64 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  39.39 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  38.89 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.02 
 
 		 563 aa  72  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  26.75 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  40.95 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  38.79 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  30.8 
 
 		 815 aa  70.1  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  37.93 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  44.83 
 
 		 751 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  29.81 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  28.52 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  42.22 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  30.85 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  30.2 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  37.93 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  30.2 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  40.57 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  39.06 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  42.55 
 
 		 757 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  37.93 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  30.2 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  37.93 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  30.2 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  30.2 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  30.2 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  25.77 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  30.2 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  37.93 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  39.06 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  40.45 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  24.35 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  31.61 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  35.71 
 
 		 547 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  40.48 
 
 		 555 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  40.7 
 
 		 725 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  29.03 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  46.25 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  37.84 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  46.25 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  32.68 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  28.44 
 
 		 677 aa  66.6  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  41.57 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  31.13 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.69 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  34.42 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  37.19 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  37.8 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  38.58 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  32.28 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  39.6 
 
 		 548 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  24.14 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  36 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  36 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  36 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  40.59 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  29.37 
 
 		 911 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  35.19 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>