More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1198 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  88.35 
 
 
249 aa  443  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  76.71 
 
 
249 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  75.9 
 
 
249 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  61.63 
 
 
249 aa  319  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  62.04 
 
 
247 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  62.2 
 
 
249 aa  314  7e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  61.63 
 
 
247 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  61.63 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  60.57 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  60.57 
 
 
248 aa  308  6.999999999999999e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  60 
 
 
247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  61.38 
 
 
250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 
251 aa  305  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  60.16 
 
 
250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  60.57 
 
 
250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 
248 aa  304  8.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  60.16 
 
 
250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  60.57 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  63.6 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  58.94 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  59.35 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  59.35 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  59.35 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  63.04 
 
 
247 aa  300  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  60.82 
 
 
247 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  56.91 
 
 
248 aa  300  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  55.28 
 
 
247 aa  299  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  58.94 
 
 
251 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.96 
 
 
248 aa  294  9e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
248 aa  293  2e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 
249 aa  290  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0432  phosphoglyceromutase  61.89 
 
 
250 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  60.82 
 
 
247 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 
247 aa  287  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  53.85 
 
 
601 aa  287  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  53.85 
 
 
248 aa  287  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  59.03 
 
 
229 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 
247 aa  285  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 
249 aa  285  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  61.23 
 
 
232 aa  284  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  60.82 
 
 
248 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 
248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  59.57 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  60.41 
 
 
270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  59.59 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  60 
 
 
247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  59.59 
 
 
270 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  60 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 
230 aa  281  7.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.37 
 
 
247 aa  281  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  58.78 
 
 
253 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  57.72 
 
 
267 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  56.91 
 
 
248 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  58.78 
 
 
293 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.1 
 
 
249 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  59.18 
 
 
270 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  59.18 
 
 
270 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  59.57 
 
 
250 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  59.18 
 
 
248 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 
248 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  58.78 
 
 
247 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 
436 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 
247 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  56.71 
 
 
233 aa  275  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 
248 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  57.44 
 
 
246 aa  275  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
230 aa  275  7e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 
253 aa  274  9e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 
228 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  60.35 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  58.47 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 
247 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 
247 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 
251 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 
251 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  52.76 
 
 
282 aa  271  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  55.95 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 
251 aa  271  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  55.95 
 
 
245 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>