27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1152 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  540  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  48.85 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  48.94 
 
 
265 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  42.8 
 
 
262 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  39.37 
 
 
259 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  37.76 
 
 
259 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  34.58 
 
 
259 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  41.48 
 
 
283 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  38.04 
 
 
281 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  32.9 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.99 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  32.68 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  34.51 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  36.28 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  40.34 
 
 
272 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  38.67 
 
 
271 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.69 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  31.22 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  27.18 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  26.03 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  25.63 
 
 
269 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  27.75 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.63 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.7 
 
 
601 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  28.97 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  31.25 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  27.66 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>