More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1126 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
174 aa  347  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  77.11 
 
 
166 aa  261  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  71.95 
 
 
167 aa  225  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  71.95 
 
 
167 aa  225  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  43.98 
 
 
164 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  49.08 
 
 
159 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  43.11 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  45.91 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  45.91 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  45.91 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  52.31 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  45.06 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  46.01 
 
 
169 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  44.79 
 
 
169 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  48.39 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  44.26 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  47.89 
 
 
170 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  43.56 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  48.77 
 
 
202 aa  127  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  46.58 
 
 
176 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  44.23 
 
 
170 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  41.57 
 
 
171 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  41.57 
 
 
171 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  41.57 
 
 
171 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  41.57 
 
 
171 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 
176 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.82 
 
 
170 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  45.4 
 
 
170 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  44.94 
 
 
169 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 
170 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  43.21 
 
 
170 aa  121  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  48.23 
 
 
174 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  48.23 
 
 
174 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  42.04 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  41.82 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  41.86 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  50.85 
 
 
171 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  41.88 
 
 
168 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  47.83 
 
 
157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 
173 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  43.9 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  44.79 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  46.97 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  50.41 
 
 
168 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 
176 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 
235 aa  114  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 
171 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  41.36 
 
 
160 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 
171 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  44.59 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
166 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 
167 aa  111  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 
153 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 
154 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 
154 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
169 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.65 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  45.32 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 
172 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  47.26 
 
 
169 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  43.18 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  40.72 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  44.76 
 
 
163 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 
164 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 
164 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  40.12 
 
 
170 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 
164 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>