More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0988 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 806 aa  1662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  44.34 
 
 		 804 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  41.95 
 
 		 726 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  41.01 
 
 		 743 aa  525  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 702 aa  465  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 698 aa  452  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.98 
 
 		 695 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 698 aa  452  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 698 aa  452  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 714 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  36.27 
 
 		 696 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  36.27 
 
 		 696 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  32.12 
 
 		 702 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  33.42 
 
 		 698 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  32.43 
 
 		 696 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.42 
 
 		 656 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 713 aa  350  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  31.5 
 
 		 696 aa  348  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 740 aa  347  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  32.71 
 
 		 663 aa  333  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  32.08 
 
 		 663 aa  323  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  31.77 
 
 		 700 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 698 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 676 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.18 
 
 		 659 aa  284  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 652 aa  280  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 663 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  30.4 
 
 		 663 aa  279  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  30.4 
 
 		 663 aa  279  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  30.53 
 
 		 641 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  30.4 
 
 		 663 aa  279  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  30.4 
 
 		 663 aa  279  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  30.4 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  30.43 
 
 		 650 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 658 aa  278  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  30.05 
 
 		 650 aa  277  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  30.05 
 
 		 650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  30.18 
 
 		 650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.14 
 
 		 732 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  30.05 
 
 		 650 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 665 aa  243  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  50.7 
 
 		 653 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  34.6 
 
 		 666 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  37.42 
 
 		 704 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  34.33 
 
 		 666 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 697 aa  197  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  35.39 
 
 		 666 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  35.39 
 
 		 666 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  35.54 
 
 		 666 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  50.82 
 
 		 655 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  36.26 
 
 		 652 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  47.64 
 
 		 665 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  46.54 
 
 		 680 aa  178  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  44.69 
 
 		 665 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  44.69 
 
 		 665 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  44.69 
 
 		 665 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  27.88 
 
 		 744 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  26.78 
 
 		 746 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.65 
 
 		 746 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  26.76 
 
 		 746 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  26.74 
 
 		 744 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  26.39 
 
 		 759 aa  166  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  26.6 
 
 		 744 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.07 
 
 		 656 aa  164  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  26.96 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  27.95 
 
 		 742 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  50.83 
 
 		 681 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 664 aa  161  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 799 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.25 
 
 		 742 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 799 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 799 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  26.65 
 
 		 757 aa  157  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  41.51 
 
 		 326 aa  156  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  45.16 
 
 		 739 aa  155  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  30.95 
 
 		 656 aa  153  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  23.81 
 
 		 740 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  45.26 
 
 		 635 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 715 aa  149  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  24.26 
 
 		 703 aa  147  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  31.75 
 
 		 572 aa  147  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  25.24 
 
 		 766 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  26.43 
 
 		 783 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 649 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  31.68 
 
 		 330 aa  140  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 653 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 		 649 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 661 aa  135  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  39.41 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 649 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 		 662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  38.98 
 
 		 662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 680 aa  131  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 657 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  37.32 
 
 		 648 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  43.6 
 
 		 713 aa  129  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  36.21 
 
 		 640 aa  124  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1978  colicin I receptor  31.1 
 
 		 351 aa  124  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>