More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0864 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
317 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  83.77 
 
 
308 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  75.79 
 
 
317 aa  464  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  76.1 
 
 
317 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  62.28 
 
 
306 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  58.61 
 
 
303 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  56.01 
 
 
303 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  54.46 
 
 
303 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  56.55 
 
 
306 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  58.21 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  56.51 
 
 
303 aa  325  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  54.52 
 
 
303 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  55 
 
 
303 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  59.87 
 
 
315 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.27 
 
 
306 aa  321  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  56.21 
 
 
303 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  60.52 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  54.33 
 
 
315 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.39 
 
 
303 aa  319  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  57.04 
 
 
303 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  57.04 
 
 
303 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  54.64 
 
 
303 aa  318  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  55.67 
 
 
309 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.82 
 
 
331 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  58.54 
 
 
303 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  58.19 
 
 
303 aa  315  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  58.19 
 
 
313 aa  315  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  54.61 
 
 
315 aa  315  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  52.65 
 
 
306 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.74 
 
 
329 aa  315  9e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  59.18 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  55.36 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  56.18 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  57.95 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  53.33 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  53.09 
 
 
335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  54.51 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.83 
 
 
323 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.83 
 
 
323 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.33 
 
 
306 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  54.33 
 
 
306 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  60.14 
 
 
305 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  59.45 
 
 
305 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  59.45 
 
 
305 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  57.34 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  59.02 
 
 
302 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  54.06 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  57.56 
 
 
321 aa  309  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  58.16 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  57 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  51.07 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  61.45 
 
 
349 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  48.56 
 
 
315 aa  305  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.48 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  52.98 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  56.21 
 
 
312 aa  301  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.85 
 
 
305 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.27 
 
 
300 aa  299  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  48.48 
 
 
350 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.84 
 
 
308 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  59.49 
 
 
317 aa  292  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.61 
 
 
325 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  54.7 
 
 
312 aa  288  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.84 
 
 
341 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.85 
 
 
313 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  51.59 
 
 
319 aa  285  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.2 
 
 
319 aa  285  9e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  49.13 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.47 
 
 
327 aa  282  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  49.66 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  49.66 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  47.92 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  51.47 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  50.74 
 
 
331 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  47.29 
 
 
308 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 
318 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  43.46 
 
 
314 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  53.58 
 
 
314 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  55.22 
 
 
315 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.66 
 
 
317 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  51.37 
 
 
316 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.18 
 
 
332 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.73 
 
 
314 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.24 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.18 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  51.44 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.936381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  49.15 
 
 
350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  43.37 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.74 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  45.79 
 
 
310 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.37 
 
 
309 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  47.54 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  46.32 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  42.63 
 
 
347 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  50.35 
 
 
313 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.88 
 
 
306 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  46.46 
 
 
305 aa  271  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.57 
 
 
302 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.79 
 
 
320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  50.74 
 
 
317 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>